Windows 10では、以下のIMEパッドのように外字領域や私用領域に文字が存在します。
(赤枠内の中点"・"は未登録部分)
しかし外字エディターでは、それらの文字は表示されません。
既に文字が登録されている箇所に外字を登録したため、本現象が発生します。
※ 例えば、「Meiryo UI」の左上先頭の0xF040は、IMEパッドで見ると虫眼鏡マーク(上図の左上先頭の0xF040)が登録されていますが、外字エディターで見ると空白(未登録)の状態になっています。外字エディターを使って、この0xF040に新たに外字を登録し使用したため、PDFファイル変換後は虫眼鏡マーク(上図の左上先頭の0xF040)で表示されてしまいます。