【原因】
紙でデータを出力する物理プリンターに対し、スカイコム製品PDF生成アプリケーション、SkyPDF Pro Driverは、仮想プリンターという位置づけになります。
この2つは、データを紙で出力するか、別のデータフォーマットで出力するかの違いがありますが、「プリンター」という意味では同じものと考えられています。
前提として、物理プリンター/仮想プリンターにかかわらず、プリンターによって印刷可能領域が異なりますので、同じファイルを紙出力/PDF出力すると、各プリンターの印刷可能領域によって出力されるページ数が変わります。
印刷プレビューで表示されたページ数と、紙印刷で出力した場合は同じページ数で出力されますが、PDFで出力するとページ数が異なることから、「通常使うプリンター」として設定された物理プリンターの印刷可能領域が、印刷プレビューに反映されているためだと考えられます。
【対処法】
Officeなどのアプリケーション側にて、文書のレイアウトを適宜調整してください。