クローニングは、スカイコムでの動作検証は行っていません。
そのため、注意点につきましてはお答えいたしかねます。
【補足】
多数のユーザー様から導入時にクローニングを行ったとの報告は受けていますが、トラブルの報告はございません。
ライセンスファイルによる認証が必要な「SkyPDF8シリーズ」については、マスターPC上でライセンスファイルによる認証を完了しても、展開先の各PC上でライセンスファイルを認証させる必要があります。
(コマンドラインによる認証で作業を軽減できる場合があります。概要については別途お問い合わせください。)